R 語言統計工具入門：用 AI 學會做臨床研究統計

一個以 Quarto 建置的開源教學書籍，教你如何善用 AI 輔助學習 R 語言，完成臨床研究統計分析 -- 從零開始，不需要程式背景。

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資源	連結
書籍網址	htlin222.github.io/learn-r-with-ai
GitHub 倉庫	github.com/htlin222/learn-r-with-ai
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課程目標

今天結束時，你將能夠：

• 把問題描述清楚，讓 AI 幫你寫程式
• 看懂 AI 給的程式碼大概在做什麼
• 當程式出錯，知道怎麼問 AI 修正
• 產出可以放進論文的表格和圖表
• 有一個可以重複使用的分析範本

這堂課的玩法

1. 我給你一個「任務」
2. 你把任務描述貼給 AI（ChatGPT / Claude）
3. AI 給你程式碼
4. 你貼到 Positron / Posit.cloud 執行
5. 我們一起看結果、理解發生了什麼

記住：你的工作是「問對問題」，不是「寫對程式」。

項目結構

learn-r-with-ai/
├── _quarto.yml                          # Quarto 書籍配置
├── _common.R                            # 全域 R 設定（字型、主題、knitr）
├── install.r                            # 一鍵安裝所有套件
│
├── index.qmd                            # 前言
├── part1.qmd                            # 第一部分：快速入門（任務 1-5）
├── part2.qmd                            # 第二部分：讀取你的資料（任務 6-8）
├── part3.qmd                            # 第三部分：產出你的 Table 1（任務 9-14）
├── part4.qmd                            # 第四部分：畫出論文等級的圖（任務 15-19）
├── part5.qmd                            # 第五部分：統計檢定（任務 20-24）
├── part6.qmd                            # 第六部分：整合與收尾（任務 25-30）
├── appendix.qmd                         # 附錄：常見技術問題與解決方案
│
├── patient_data.csv                     # 主要教學資料（100 筆病人）
├── patient_data_for_survival.csv        # 存活分析資料（100 筆）
├── patient_data_meta.csv                # 統合分析資料（8 篇研究）
│
├── boxplot_los.R                        # 範例：盒狀圖腳本
├── multi_panel_plot.R                   # 範例：多面板組合圖
├── meta_analysis.R                      # 範例：統合分析
├── mission1.r                           # 範例：存活分析
│
├── references.bib                       # 參考文獻（BibTeX）
├── american-medical-association.csl      # AMA 引用格式
├── presentation-complete.Rmd            # 完整課程簡報
├── presentation-part1.Rmd              # 第一部分簡報示範
├── styles.css                           # 簡報樣式
├── README.md                            # 本文件
└── LICENSE                              # MIT 授權

構建說明

安裝依賴

確保您已安裝：

• Quarto
• R
• IDE 選擇（任選一個）：
  • Positron - Posit 新一代 IDE
  • Posit.cloud - 雲端開發環境（免安裝）

構建書籍

quarto render

這將生成 HTML 和 PDF 版本的書籍在 _book/ 目錄中。

預覽書籍

quarto preview

這將啟動一個本地服務器來預覽書籍。

使用簡報功能

本項目包含 R Markdown 簡報文件，可以在 Positron / Posit.cloud 的 Presentation 標籤中使用：

1. 開啟簡報檔案：

   • presentation-complete.Rmd - 完整課程簡報
   • presentation-part1.Rmd - 第一部分示範簡報

2. 在 Positron / Posit.cloud 中使用：

   • 開啟 .Rmd 檔案
   • 點擊 Knit 按鈕
   • 選擇 "Knit to HTML (ioslides)"
   • 簡報會在 Presentation 標籤中顯示

3. 簡報控制：

   • 使用方向鍵切換投影片
   • 按 f 進入全螢幕模式
   • 按 w 切換到黑白模式
   • 按 o 顯示簡報概覽

資料說明

本課程使用 patient_data.csv 檔案，包含以下欄位：

欄位	說明
patient_id	病人編號
treatment	治療組別（A 或 B）
age	年齡
gender	性別（M 或 F）
los	住院天數（length of stay）

聯繫信息

講師：林協霆 日期：2025/12/05

License

This project is licensed under the MIT License.