refactor: reorganize root directory structure

- Move spec.md → docs/, install-hook.sh → scripts/
- Merge single-file dirs: resources/ → templates/, benchmark-results/ → data/, manifests/ → schemas/, project-templates/ → templates/language/
- Group scripts: gc/, metrics/, verify/ subdirectories
- Update all path references across package.json, docs, hooks, commands

Author: majiayu000

.claude/commands/vibeguard/check.md

@@ -69,7 +69,7 @@ argument-hint: "[project_dir]"
 
 3. **运行合规检查**
    ```bash
-   bash ${VIBEGUARD_DIR}/scripts/compliance_check.sh <project_dir>
+   bash ${VIBEGUARD_DIR}/scripts/verify/compliance_check.sh <project_dir>
    ```
 
 4. **汇总报告**
@@ -126,6 +126,6 @@ argument-hint: "[project_dir]"
 
 **Reference**
 - VibeGuard 守卫脚本：`vibeguard/guards/`
-- VibeGuard 合规检查：`vibeguard/scripts/compliance_check.sh`
+- VibeGuard 合规检查：`vibeguard/scripts/verify/compliance_check.sh`
 - 配合 `/vibeguard:preflight` 使用效果最佳
 <!-- VIBEGUARD:CHECK:END -->

.claude/commands/vibeguard/gc.md

@@ -24,13 +24,13 @@ tags: [vibeguard, gc, cleanup, maintenance]
 **Steps**
 
 1. **日志归档**
-   - 运行 `bash ${VIBEGUARD_DIR}/scripts/gc-logs.sh`
+   - 运行 `bash ${VIBEGUARD_DIR}/scripts/gc/gc-logs.sh`
    - events.jsonl 超过 10MB 时按月归档（gzip）
    - 保留最近 3 个月，更老的自动删除
    - 输出归档统计
 
 2. **Worktree 清理**
-   - 运行 `bash ${VIBEGUARD_DIR}/scripts/gc-worktrees.sh`
+   - 运行 `bash ${VIBEGUARD_DIR}/scripts/gc/gc-worktrees.sh`
    - 删除超过 7 天未活跃且无未合并变更的 worktree
    - 有未合并变更的只警告，列出需要手动处理的
 
@@ -59,7 +59,7 @@ tags: [vibeguard, gc, cleanup, maintenance]
    - 修复后运行 `/vibeguard:check` 验证
 
 **Reference**
-- 日志归档: `scripts/gc-logs.sh`
-- Worktree 清理: `scripts/gc-worktrees.sh`
+- 日志归档: `scripts/gc/gc-logs.sh`
+- Worktree 清理: `scripts/gc/gc-worktrees.sh`
 - 代码垃圾检测: `guards/universal/check_code_slop.sh`
 <!-- VIBEGUARD:GC:END -->

.claude/commands/vibeguard/learn.md

@@ -352,6 +352,6 @@ argument-hint: "<错误描述 | 'extract' 提取经验 | 空=自动判断>"
 - Hook 脚本模板：`vibeguard/hooks/`
 - 规则文件：`vibeguard/rules/`
 - 规则索引：`vibeguard/claude-md/vibeguard-rules.md`
-- Skill 模板：`vibeguard/resources/skill-template.md`
+- Skill 模板：`vibeguard/templates/skill-template.md`
 - 学术参考：Voyager (skill libraries), CASCADE (meta-skills), Reflexion (self-reflection)
 <!-- VIBEGUARD:LEARN:END -->

.claude/commands/vibeguard/preflight.md

@@ -169,5 +169,5 @@ tags: [vibeguard, preflight, constraints, prevention]
 **Reference**
 - VibeGuard 守卫脚本：`vibeguard/guards/`
 - VibeGuard 规则：`vibeguard/rules/`
-- VibeGuard 七层防幻觉框架：`vibeguard/spec.md`
+- VibeGuard 七层防幻觉框架：`vibeguard/docs/spec.md`
 <!-- VIBEGUARD:PREFLIGHT:END -->

README_CN.md

@@ -437,23 +437,23 @@ vibeguard/
 │   └── claude-rules/                     #   原生规则（部署到 ~/.claude/rules/vibeguard/）
 │       ├── common/                       #     coding-style(U-01~U-26) + data-consistency + security + workflow(W-01~W-05)
 │       ├── rust/ golang/ typescript/ python/  #  语言质量规则（带 paths 作用域）
-├── resources/skill-template.md           # Skill 提取模板
+├── templates/skill-template.md           # Skill 提取模板
 ├── skills/                               # 可复用工作流
 ├── scripts/                              # 工具脚本
 │   ├── setup/                            #   安装/卸载/检查脚本
 │   ├── stats.sh                          #   统计分析
 │   ├── quality-grader.sh                 #   质量等级评分（A/B/C/D）
-│   ├── doc-freshness-check.sh            #   文档新鲜度检测
+│   ├── verify/doc-freshness-check.sh     #   文档新鲜度检测
 │   ├── log-capability-change.sh          #   能力进化日志
 │   ├── constraint-recommender.py         #   preflight 约束自动推荐
-│   ├── gc-logs.sh                        #   日志归档
-│   ├── gc-worktrees.sh                   #   Worktree 清理
-│   ├── gc-scheduled.sh                   #   定期 GC（launchd 调度，每周日 3:00）
+│   ├── gc/gc-logs.sh                     #   日志归档
+│   ├── gc/gc-worktrees.sh                #   Worktree 清理
+│   ├── gc/gc-scheduled.sh                #   定期 GC（launchd 调度，每周日 3:00）
 │   ├── project-init.sh                   #   项目级脚手架（语言检测 + 守卫激活 + pre-commit/pre-push 安装）
-│   ├── metrics-exporter.sh               #   Prometheus 指标导出
+│   ├── metrics/metrics-exporter.sh       #   Prometheus 指标导出
 │   └── ci/                               #   CI 验证脚本
 ├── context-profiles/                     # 上下文模式（dev/review/research）
-└── spec.md                               # 完整规范
+└── docs/spec.md                          # 完整规范
 ```
 
 ## CLAUDE.md 模板

benchmark-results/2026-03-24.json data/benchmark-2026-03-24.jsonbenchmark-results/2026-03-24.json renamed to data/benchmark-2026-03-24.json

@@ -342,13 +342,13 @@ bash scripts/benchmark.sh --mode=full
 ### 6.4 历史存档
 
 ```
-benchmark-results/
+data/
   2026-03-23.json
   2026-03-16.json
   ...
 ```
 
-每次运行追加结果到 `benchmark-results/`，`scripts/benchmark.sh` 自动对比上次结果输出 delta。
+每次运行追加结果到 `data/`，`scripts/benchmark.sh` 自动对比上次结果输出 delta。
 
 ---
 

docs/benchmark-design.md

@@ -388,7 +388,7 @@ Hook 升级（强制警告，打断 Agent 循环）
 | `hooks/post-build-check.sh` | 构建检查 + 连续失败升级（U-25 机械化） |
 | `scripts/gc-scheduled.sh` | GC 定期学习（跨会话模式识别） |
 | `.claude/commands/vibeguard/learn.md` | /vibeguard:learn 命令（双模式路由） |
-| `resources/skill-template.md` | SKILL.md 写作模板 |
+| `templates/skill-template.md` | SKILL.md 写作模板 |
 | `skills/*/SKILL.md` | 已提取的 Skill 文件 |
 
 ## 与 OpenAI Harness 的对标

docs/how/learning-skill-generation.md

@@ -285,7 +285,7 @@ task_contract:
 
 ```
 vibeguard/
-├── spec.md                             # 本文件（~500行）- 完整规范
+├── docs/spec.md                        # 本文件（~500行）- 完整规范
 ├── README.md                           # 快速开始（~50行）
 ├── setup.sh                            # 一键部署（~30行）
 │
@@ -336,7 +336,7 @@ vibeguard/
 │   └── typescript/
 │       └── eslint-guards.ts            # TS 守卫模板
 │
-├── project-templates/
+├── templates/language/
 │   ├── python-CLAUDE.md                # Python 项目 CLAUDE.md 模板
 │   ├── typescript-CLAUDE.md            # TS 项目 CLAUDE.md 模板
 │   └── rust-CLAUDE.md                  # Rust 项目 CLAUDE.md 模板

spec.md docs/spec.mdspec.md renamed to docs/spec.md

@@ -4,8 +4,8 @@
 # Blocks force pushes at the git level — this is the correct separation of
 # concerns vs. regex-matching git commands in the bash guard.
 #
-# Install via install-hook.sh:
-#   bash install-hook.sh <project_dir>
+# Install via scripts/install-hook.sh:
+#   bash scripts/install-hook.sh <project_dir>
 #
 # The hook receives push refs on stdin:
 #   <local-ref> <local-sha> <remote-ref> <remote-sha>